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恩格尔曼的第二个实验得出的结论是：叶绿体主要吸收红光和蓝光用于光合作用，放出氧气。叶绿体是绿色植物进行光合作用的场所。这对理解绿色植物的生长和结构至关重要。
恩格尔曼实验
(1)1880年，他用水绵进行了光合作用的实验：
把载有水绵和好氧细菌临时装片放在没有空气的黑暗环境里，然后用极细的光束照射水绵，通过光学显微镜观察发现，好氧细菌向叶绿体被光束照射到的部位集中；如果上述临时装片完全暴露在光下，好氧细菌则分布在叶绿体所有受光部位的周围。从而证明：氧是由叶绿体释放出来的，叶绿体是绿色植物进行光合作用的场所。
(2)他在证明光合作用放氧部分是叶绿体后，紧接着又做了一个实验：他用三棱镜的光照射水绵临时装片，惊奇地发现大量的好氧细菌聚集在红光和蓝光区域。从而证明叶绿体中色素吸收红光、蓝紫光，用于光合、放出氧气。
恩格尔曼的实验巧妙之处
材料：水绵----水绵的叶绿体呈螺旋式带状，便于观察
好氧细菌----可以确定释放氧气多的部位
环境：没有空气----排除了氧气的干扰
黑暗环境中----排除了光的干扰
对照实验：极细的光束----使叶绿体上可分为有光和无光部位形成对照实验
还可使叶绿体上分为光多和光少的部位形成对比实验
临时装片要重新暴露在光下----反过来再一次验证实验结论